[maven-release-plugin] prepare release rel/2.0.0-alpha-1

Set version to 2.0.0-alpha-1-SNAPSHOT

Cleanup deprecation stuffs (#689)

* Add missing since information for deprecations, including properties
* Fix various javadoc syntax
* Remove deprecated import statements and suppress deprecations in
  tests, to limit spam from compiler warnings

Fix #633 use annotations for spotbugs (#687)

Triage all spotbugs excludes from the exclude-filter.xml files and
either implement a fix or document a justification with annotations.

Also add travis-ci task to build with the sec-bugs profile to check for
future security-related issues found by spotbugs.

Clean up unnecessary plugin configuration in POM

Remove unnecessary m2e plugin lifecycle configuration. Due to the phase
of the plugin execution, some plugins do not trigger in the portion of
the lifecycle handled by m2e, so do not need actions specified in the
configuration. Other plugins have actions specified by default in their
plugin metadata, and don't need to be specified here.

Fix #684 Move accumulo-maven-plugin from build (#686)

This removes accumulo-maven-plugin from this main accumulo repo. The
corresponding addition can be found in the new repo named
accumulo-maven-plugin.

Rename link on Monitor to REST (#685)

Revert "Work around compilation bug in Eclipse Oxygen"

Fixes #485; workaround not needed in latest version of Eclipse Photon

This reverts commit b49865d08f3edb425306c3e48689c8836d947ad5.

Fixed dead link for developers guide in CONTRIBUTING.md (#682)

This fixes #681

Add methods to set props in Rfile summaries. Fixes #612 (#679)

Make Connector same as it is in 1.9 (#678)

Make accumulo-maven-plugin work with older mvn

(Fixes broken build with most common versions of Maven)

Partially revert #670 to restore minimum requirement for
accumulo-maven-plugin to 3.2.5, instead of requiring 3.5.4

(Partial revert of 23fb8b393d745f8ec5c12ed24de637addb0b62b8)

Set props path in ConfigOpts. Fixes #676 (#677)

Format

Make shell script commmand backwards compat (#671)

Merge pull request #675 from keith-turner/fix-native

Fix accumulo-util script

* Fix variable name typo for native_tarballs
* Fix issues identified by shellcheck

Update travis-ci settings (#672)

* Remove IRC notifications (nobody lurks in IRC anymore, so this isn't useful)
* Unset _JAVA_OPTIONS to restore default Java options, so plugins don't
  run out of memory and cause the container to get killed
* Remove forking for unit tests; the container doesn't have a lot of CPU
  to fork anyway, and removing this helps with excessive memory utilization
* Use openjdk8
* Use sudo-enabled containers for travis-ci

Clarify RFile withTableProps javadoc. Fixes #611

Clarify RFile withTableProps javadoc. Fixes #611 (#674)

Removed uneeded code

Fix script to build native libs

Fixes #561 - Be explicit about aliases in shell (#673)

- Explicitly state that deletetable and droptable are the same

Merge branch '1.9'

 Conflicts:
core/src/main/java/org/apache/accumulo/core/data/Mutation.java

Use optimized writeV methods in Mutations (#669)

* Moved optimized writeVLong and writeVInt to UnsynchronizedBuffer
to replace use of WriteableUtils methods. Each optimized method will
only make one write call to the underlying outputstream.

Fixes #421 Organize Fate Operations (#663)

* Clean up tableOps directory to be organized by Fate operation.

Fixes #622 - Include version in Jar filenames of Accumulo deps (#667)

Update Accumulo dependencies (#670)

* Also have TravisCI compile with older versions of
  Hadoop & Zookeeper

Add space aware volume chooser (#645)

Sort Modifiers for consistency. (#665)

Refactored AccumuloClient variable names (#664)

* Removed unused code

Removed redundant modifiers on AccumuloClient interface (#661)

* Removed redundant use of public and abstract

Link to API definition on website (#660)

Merge branch '1.9'

Update commons-configuration to latest 1.x (#659)

* Update to configuration-commons 1.10
* Add deprecation notice for newly inherited method on ClientConfiguration

Merge branch '1.9'

Introduce a property for a key password for the Monitor keystore file

Java keystores can have a keystore password as well as a password on the private key contained inside of that keystore
(when that keystore may contain multiple keys). Usually, but not always, the "key password" is the same as the
keystore password. This commit introduces a new property to allow this configuration.

Revert "Do not require a password on the truststore JKS"

This reverts commit 1213c9a9d179e7202e56bbd171303e9dacb3e223.

Updates for standalone cluster (#657)

Merge branch '1.9'

Roll back maven-invoker-plugin 3.1.0->3.0.1

A bug exists in maven-invoker-plugin 3.1.0 which causes the maven-plugin
module to fail to build, due to missing SNAPSHOT dependencies copied
into the PluginIT's local repository from sibling modules. This is
because transitive dependencies fail to be copied, as they were in 3.0.1
of the plugin.

See https://issues.apache.org/jira/browse/MINVOKER-243

Merge branch 'document-api' closes #656

Move public API docs to Accumulo.java (#656)

Move Accumulo class to API package (#656)

Addendum to #636 that I had staged by not committed.

Addendum to #636 to fix maven-plugin's IT.

Merge branch '1.9'

 Conflicts:
core/pom.xml
examples/simple/pom.xml
pom.xml

Remove httpclient dependency. (#655)

* was present for Hadoop 1, which we don't support anymore
* was present for ThreadSafe note on our maven-plugin mojo, but that annotation is gone in current releases

Tested via running ITs locally and against a standalone hadoop 2 cluster

Merge branch '1.9'

AccumuloFileOutputFormatITs need to look on local filesystem for results written into JUnit provided temp dir. (#654)

Before this change the {mapred,mapreduce}.AccumuloFileOutputFormatITs would work against a minicluster backed by
Hadoop's LocalFileSystem, but fail if one followed the instructions for testing against a stand alone cluster.

The failure is because in the cluster case the FileSystem we get is for the HDFS instance underlying the
Accumulo cluster, which can't find the folder JUnit created for our test.

Fix performance of crypto (#652)

* Remove use of DiscardCloseOutputStream from WAL encryption
* Override inefficient write method in DiscardCloseOutputStream and NoFlushOutputStream
* Changed NoFlushOutputStream to extend FilterOutputStream, which doesn't have synchronized methods like DataOutputStream does

Merge branch 'accumulo-client' Closes #636

Updates from pull request #636

Replace getConnector() with getClient() #636

Replace AccumuloClient.builder() with Accumulo.newClient() #636

Create Accumulo class as main entry point #636

Fix javadoc #636

Replaced uses of Connector with AccumuloClient #636

Deprecate Connector #636

* Created Connector.from() as a bridge between it and AccumuloClient
* Moved new builder API to AccumuloClient

Created AccumuloClient from Connector #636

Merge branch '1.9'

Correct how Continuous Ingest specifies the debug log file (#651)

TServerUtilsTest fails on master and OSX

A couple of tests fail in this class because the test binds to localhost:<port>
but then TServerSocket (via TServerUtils) binds to `0.0.0.0` which doesn't
cause an exception to be thrown (testing for the port collision).

Closes #649

Signed-Off-By: Christopher Tubbs <ctubbsii@apache.org>
Signed-Off-By: Keith Turner <keith@deenlo.com>

Rename new Bulk import API (#648)

* Also added an example for importDirectory fluent API

Merge branch '1.9'

Do not require a password on the truststore JKS

A password on a truststore provides no security value, only validation
that the JKS is the JKS that the user expects. Log a warning when the
truststore is empty.

Closes #646

Signed-off-by: Josh Elser <elserj@apache.org>

Do not require a password on the truststore JKS

A password on a truststore provides no security value, only validation
that the JKS is the JKS that the user expects. Log a warning when the
truststore is empty.

Closes #646

Signed-off-by: Josh Elser <elserj@apache.org>

Fix LoadPlanTest failure

Fix failure due to apparent rename of RangeType enums during
development, without accompanying rename in test.

Also, clean up the punctuation and fix a typo in the javadoc for
RangeType enum values.

Fix checkstyle failures

Use static import for Assert.* methods

Merge branch '1.9'

Fix javadoc doclint settings

Use new doclint option for maven-javadoc-plugin 3.0.0 and later; this
is necessary to suppress unimportant javadoc warnings that were
previously suppressed differently. The previous method no longer works
in the current version of the plugin.

Also fix warning about javadocVersion by being more specific.

ACCUMULO-4813 Add ability to provide a load plan for bulk import (#607)

Fix plugin build with skipQA profile (#643)

The command 'mvn install -PskipQA' allows quick install for
testing.  However the accumulo maven plugin built by this
command was not working.  This change fixes that.

Add experimental props to doc gen (#644)

* Printed the experimental properties inline with all properties
* Removed inner classes cluttering up ConfigurationDocGen

 Fix crypto tests writing to /tmp (#641)

Rename some Crypto terms for easier configuration (#640)

* Changed instance.crypto.opts.kekId to instance.crypto.opts.key.location
* Changed instance.crypto.opts.keyManager to instance.crypto.opts.key.provider

Update travis config: drop hadoop profile

Accumulo master branch (2.0.0-SNAPSHOT) only supports Hadoop 3, so we
don't need to build twice in Travis, one for Hadoop 3 and one for the
default Hadoop profile, like we do in the 1.9 maintenance branch.

Merge branch 'pom-update-626'

Upgrade findbugs to spotbugs for 1.9

(Backport of #615 to the 1.9 branch with some updates)

* Upgrade findbugs to spotbugs 3.1.6
* Rename all findbugs to spotbugs (with various capitalizations)
* Remove README.spotbugs/README.findbugs (contains incorrect info and not useful)

Fix #626 Update to apache-21 parent POM

* Update parent POM to apache-21
* Update build plugin configuration obsoleted by POM update
* Update other build plugins
* Build with JDK8 to use plugins which aren't out-of-date

This change requires Java 8 for building the project, because the
updates to Maven plugins are getting harder

Fix PrintInfo command and VolumeChooserIT

* Fix PrintInfo's incorrect use of "-site" instead of "-props" (I think
this one may have been causing ReadWriteIT to blow up in some cases, but
I only saw this locally, and never on Jenkins, so I'm not certain)

* Fix ChooseDir implementation to correctly pass the master's
ServerContext, so that creating new tablets didn't break for volume
choosers which needed access to the server configuration; this fixed a
test failure with VolumeChooserIT; also removed constructors exposed
only for testing, because they were too easily misused for non-tests

Merge branch '1.9'

Fix #639 Update JUnit usage

* Use JUnit4 annotations instead of TestCase
* Use static imports for Assert methods, for consistency
* Enforce with checkstyle rules

Merge branch '1.9'

Use slf4j syntax for key in log message

Upgrade httpclient to 4.5.6 (#638)

* Removed use of @ThreadSafe annotation as it was
  dropped in 4.5.6

Fix ITs broken by SecureRandom

Merged in changes for 573 into code correcting compiler errors due to
changes in master since PR was initially opened.

#573 Merged in changes from GH-573

Put stacktrace back in visibility exceptions

Fix warnings from dependency updates (#629)

* Fix warnings from dependencies updated in #614
* Use UTF_8 static imports consistently
* Fix null checks in HostAndPort class instead of excluding from spotbugs
* Fix additional minor compiler warnings from maven command line

Restore deprecated instance methods removed in 0ba6c49 (#635)

Restoring these for following reasons :

 * Any project that implemented Instance still had to implement deprecated
   methods.
 * Multiple projects currently have code that call these methods.
 * All of Instance is now deprecated.
 * Use of Java 8 default methods makes restoration trivial with single line
   implementations that have negligible maintenance burden.

Add sec-bugs plugin. Closes #618 (#628)

* Created build profile for sec-bugs
* Replaced Math.Random with SecureRandom
* Sanitize user input in log messages to prevent potential CRLF injection
* Use SHA-256 instead of MD5 or SHA-1
* Remove unused method in CryptoUtils
* Replace vulnerable regex in Monitor param validation

Remove usage of site file/config terminology (#632)

Switched to using HADOOP_HOME for Hadoop 3.x (#630)

Improved error message if accumulo-site.xml found (#627)

ACCUMULO-4854 : DfsLogger exceptions (#616)
   Removed translation of ClosedChannelException to a LogClosedException in the write method as that is done by callers of the method.

Stop sending error message in bean validation response (#625)

Fixes build after it was broken by #614

* Due to API change from commons-configuration 1.6 to 1.10

Updated Accumulo dependencies and classpath (#614)

* Limited the number of dependencies from Hadoop
* Upgraded several dependencies including ZooKeeper,
  Jetty, Guava, Gson, Jersey, Bouncy Castle, ClassMate,
  FreeMarker, Caffeine, commons-cli, commons-codec,
  commons-configuration, commons-io, commons-lang,
  commons-logging, javax.ws-rs-api, HK2