CLIMATE-625 Update draw_histogram and draw_marker_on_map documentation

Merge branch 'master' into CLIMATE-931

Merge branch 'master' of https://git-wip-us.apache.org/repos/asf/climate

CLIMATE-931 Documentation build error - missing module

Merge branch 'CLIMATE-932'

CLIMATE-932 - A whitespace error in running the CORDEX script

- RCMES/run_RCMES.py has been fixed

Update plotter unit tests for _best_gridshape changes

CLIMATE-927 - RCMES script for running multiple evaluations

Update local_multiple_files tests for 1D lats and lons

CLIMATE-930 - multiple file loader forces 2D lats and lons

Incorrect indices used for temporal subset after trimming

CLIMATE-928 - temporal_subset should trim edges of dataset times to ensure months divide evenly into years

CLIMATE-925 - CORDEX Config File Template

Ignore start and end times when maximum_overlap is True

Default values for filename_pattern in split file loader

Allow acronyms for CORDEX domains

Default vales for subplot grid in RCMES script

Allow acronyms for CORDEX domains

CLIMATE 919 - load_dataset_from_multiple_netcdf_files() does not have default variable units

Merge branch 'CLIMATE-926'

Fix model attribute in CORDEXMetadataExtractor

CLIMATE-926 - Metadata Extractors

CLIMATE-923 ocw-parallel multicore support Python3 support

Merge branch 'master' of https://github.com/BrianWilson1/climate

CLIMATE-922 Optimize traversing in mccSearch

CLIMATE-912 Upgrade mccSearch code from Python2 > 3

Added ocw-parallel directory for first version of multicore support.

Merge branch 'master' into CLIMATE-912

CLIMATE-887 - test_local.py speed and style guide improvements

- Change multiple tests (including test_get_netcdf_variable_names) to run setUp code once.
- Use small static local file TestGetNetcdfVariableNames.nc as test data for test_get_netcdf_variable_names.
- Clean up PEP8/257 warnings.

Merge branch 'patch-1' of https://github.com/Kejia/climate

Merge branch 'patch-1' of https://github.com/cclauss/climate

import os

`os` used on lines 66 and 75.

CLIMATE-920 Make examples Python 3 compatible

Merge branch 'CLIMATE-918'

more latitude and longitude name options have been added

CLIMATE-918 - Revise LAT_NAMES and LON_NAMES

- LAT_NAMES and LON_NAMES in ocw.data_source.local have been revised to prevent loading wrong variables for longitudes and latitudes when using OCW loaders

optimizing traversing

optimizing code

Merge branch 'CLIMATE-916'

CLIMATE-915 - Checking netcdf files' file format

- ocw.utils.decode_time_value has been fixed

Merge branch 'CLIMATE-915'

CLIMATE-915 - Updates for the NARCCAP example configuration files

- Fig14_and_Fig15.yaml, Fig16_summer.yaml, and Fig16_winter.yaml have been updated.

Merge branch 'CLIMATE-914'

the unreasonable reshaping of latitude and longitude was replaced by the numpy.meshgrid

CLIMATE-914 - Update dataset_processor.spatial_regrid module

- map_coordinates has been replaced with scipy.interpolate.griddata.

Merge branch 'CLIMATE-913'

CLIMATE-913 - Bugs in CLI

All of the options shown in the run screen work after applying this fix.

CLIMATE-912 Upgrade mccSearch code from Python2 > 3

CLIMATE-529 Verify that Nio dependency has been removed from mccsearch

Trivial update to README to accomodate current API documentation

Convert spaces to tabs to make codebase consistent.

Update README badges

Prepare for 1.2.0 relese

CLIMATE-885 Upgrade to Podaacpy 1.9.0

CLIMATE-885 Upgrade to Podaacpy 1.9.0

Merge branch 'CLIMATE-907'

CLIMATE-907 - Fix VisibleDeprecationWarning's in ocw.tests.test_dataset_processor.TestTemporalSubset

- By applying int() to central_index, the warning has been addressed.

Merge branch 'CLIMATE-909'

CLIMATE-909 - An example script to evaluate joint PDF of precipitation intensity and duration

- A new example, GPM_WRF24_JPDF_comparison, has been added.
- Joint PDF metric has been debugged.
- A new plotting module, draw_precipitation_JPDF, has been added.

ntime % nmonth should always be 0 for reshape / rebin

Merge branch 'CLIMATE-905'

debugging dataset_processor for subregion objects without start and end attributes

CLIMATE-905 - Box whisker plot to evaluate simulated trends

- example/temperature/trends_over_CONUS.py has been updated
- data_source.local.load_multiple_files has been updated to load the CMIP5 files without file concatenation.
- dataset_processor has been updated.
- plotter has a new module (draw_plot_to_compare_trends) to generate a plot to compare observed trends with simulated ones.
- test_local.py has been updated to reflect the changes in
- utils.calculate_temporal_trend_of_time_series has been debugged.
- utils.calculate_ensemble_temporal_trends has been updated.

Merge branch 'CLIMATE-903'

CLIMATE-903

- Landscale code quality has been improved
- test_dataset_processor has been updated for the updated temporal_slice module

CLIMATE-903 - Adding a module to calculate the least square trend and standard error

- debugging in dataset_processor
- A new module (utils.calculate_temporal_trends) to calculate the least square trend and standard error in the input time series.
- A new module (plotter.fill_US_states_with_color) to visualize US NCA regions

Merge branch 'CLIMATE-899'

CLIMATE-899 - Update the GPM loader

- ocw.data_source.local.load_GPM_IMERG_files_with_spatial_filter has been added

Merge branch 'CLIMATE-902'

CLIMATE-902 - Debugging regrid_spatial_mask

- Several bugs in ocw.utils have been fixed.

Merge branch 'CLIMATE-901'

CLIMATE-901 - Debugging calc_histogram_overlap

- ocw.metrics.calc_histogram_overlap has been updated.

Merge branch 'CLIMATE-900'

CLIMATE-900 - Debugging temporal subset

-ocw.dataset_processor.temporal_subset has been updated.

Merge branch 'CLIMATE-898'

numpy.concatenate => ma.concatenate

CLIMATE-898 - Debugging WRF loaders

- ocw.data_source.local.load_WRF_2d_files/load_WRF_2d_files_RAIN have been updated.

Make sure numpy arrays have integer shape

Make automatic contour intervals consistent between matplotlib versions

CLIMATE-894 - Debugging regrid_spatial_mask

CLIMATE-893 - Debugging wet_spell_analysis

CLIMATE-892 - Fix GPM IMERG data loader

CLIMATE-894 - Debugging regrid_spatial_mask

- ocw.utils.regrid_spatial_mask has been debugged.

fixed2

fixed

CLIMATE-892 - Fix GPM IMERG data loader

ocw.data_source.local.load_GPM_IMERG_files has been fixed to maintain the information on missing values.

Bug fixes in run_RCMES.py

Update config files

Update run_RCMES.py to treat obs and model datasets the same

Merge branch 'CLIMATE-886'

CLIMATE-886 Upgrading frontend dependencies

CLIMATE-863 - Address warning, etc within Travis-CI log output

revert augmentation of ocw/tests/test_podaac.py

Merge branch 'CLIMATE-889' of github.com/jarifibrahim/climate into CLIMATE-889

CLIMATE-890 - Changing time format when calendar in the netcdf file is 360_day
- utils.decode_timevalues has been updated

landscape warning have been fixed

CLIMATE-890 - Changing time format when calendar in the netcdf file is 360_day

- utils.decode_time_values has been updated

CLIMATE-889 - Fix Travis Build

- Skip test if unable to download the dataset

CLIMATE-877 Adding PODAAC data source to OCW GUI

Remove debugging print statement